Za umestitev trase drugega tira železniške proge Divača–Koper je bilo konec devetdesetih izdelanih sedem variant. Med njimi so bile tudi variante, ki potekajo v celoti ali delno vzporedno z obstoječo progo.
Že leta 2005 je bila kot najustreznejša potrjena aktualna predorska trasa, podprle so jo tudi vse lokalne skupnosti in pristojna ministrstva. Zanjo je takratna vlada tudi sprejela Uredbo o Državnem lokacijskem načrtu. Leta 2014 so bile sprejete dopolnitve uredbe, na podlagi katerih je trasa dokončno umeščena v prostor.
Skupaj je bilo preučenih kar 17 različnih variant tras, in sicer deset v postopku izbire trase in dodatnih sedem za oceno evropskih finančnih inštitucij in tehnično kontrolo agencije Jaspers. S tehničnih, okoljskih, ekonomskih in varnostnih vidikov se je na izkazalo, da je izbrana trasa optimalna.